m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態(tài)發(fā)布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析（圖3）。免疫系統(tǒng)，人體的免疫系統(tǒng)由免疫細胞、免疫分子構成。湖北血液科研技術服務分離

代謝組學的研究對象大都是相對分子量在1000以內的小分子物質，因此常用的血液樣本在取樣后，應小心操作，防止溶血，盡快分離出血清，分置于溫環(huán)境下保存。由于用于理實驗的動物采集相對其他樣品的采集，操作更繁瑣，在處理過程中許多細節(jié)容易忽略，造成數(shù)據(jù)不完美（甚至不能用）。因此接下來將重點介紹樣品采集的注意事項及其固定。樣品采集注意事項應新鮮，操作時間盡可能短，否則細胞發(fā)生死后變化、自融及現(xiàn)象。是動物心臟還在跳動時采集，樣本取出后在5分鐘以內置于固定液內，避免長時間暴露在空氣環(huán)境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過5mm為宜，較為理想的厚度為2mm左右，主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內部。勿使塊受擠壓。在采集過程中，應盡量選擇較為鋒利的手術，如手術刀片等，避免操作過程中擠壓挫傷標本。擠壓過的均不可用。固定液的量一般以塊大小的20倍為宜，能夠在容器內自由移動。盡量保持的原有形態(tài)。新鮮經固定后，或多或少產生收縮現(xiàn)象（如胃腸），為此可將展平，以盡可能維持原形。保持清潔。塊上如有血液、污物、粘液、食物、糞便等，可用生理鹽水沖洗，然后再入固定液，但要注意防止損傷。要熟悉采集部位。要能準確的按解剖部位采集。海南豚鼠科研技術服務實驗室免疫沉淀技術是一種研究蛋白質間交互作用的生物技術。

且研究表明HNRNPC通過m6A與RNA結合調控目標轉錄本的豐度和選擇性剪切[9].圖1m6A修飾的酶系統(tǒng)[10]m6A生物學功能越來越多的證據(jù)表明m6A修飾在哺乳動物中發(fā)揮重要的生物功能。例如，在轉錄水平上調控RNA的穩(wěn)定性[11]、定位[12]、運輸、剪切[13]和翻譯[14]。ClaudioR.等發(fā)現(xiàn)依賴METTL3的pri-miRNA甲基化，會促進DGCR8識別和加工，從而促進microRNA的成熟[15]。此外，m6A識別蛋白HNRNPA2B1促進pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外，環(huán)狀RNA上m6A的修飾能促進環(huán)狀RNA的翻譯[17]。m6A修飾在基因表達調控中起著重要的作用，其調控機制的異常可能與人類疾病或相關。目前發(fā)現(xiàn)m6A可能會影響精子發(fā)育（ALKBH5，METTL3，Ythdc2）、發(fā)育（METTL3、FTO、ALKBH5）、免疫（METTL3）、UV誘導的DNA損傷反應（METTL3，F(xiàn)TO）、生成（YTHDF2）或轉移（METTL14）、干細胞更新（METTL14）、脂肪分化（FTO）、生物節(jié)律、細胞發(fā)育分化、細胞分裂及其它的一些生命過程。例如，ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修飾，其特點是凋亡影響減數(shù)分裂中期的精子細胞，引起生育能力受損[7]。METTL3和METTL14增加弱精癥精子的m6A水平[18]，在生殖細胞中，METTL3的敲除嚴重抑制精子分化和減數(shù)分裂的發(fā)生。

用一次定量放血法可擺分之擺造成出血性休克，擺分之擺死亡，這就符合可重復性和達到了標準化要求。(三)可靠性復制的動物模型應該力求可靠地反映人類疾病，即可特異地、可靠地反映某種疾病或某種功能、代謝、結構變化，應具備該種疾病的主要癥狀和體征，經化驗或X線照片、心電圖、病理切片等證實。若易自發(fā)地出現(xiàn)某些相應病變的動物，就不應加以選用，易產生與復制疾病相混淆的疾病者也不宜選用。(四)適用性和可控性供醫(yī)學實驗研究用的動物模型，在復制時，應盡量考慮到今后臨床應用和便于控制其疾病的發(fā)展，以利于研究的開展。(五)易行性和經濟性在復制動物模型時，所采用的方法應盡量做到容易執(zhí)行和合乎經濟條件原則。以上就是上海研錄為你分享的小知識，如果想要了解更多相關內容，可與我們聯(lián)系，我們期待您的來電!科研中我們涉及到的免疫沉淀實驗通常指：免疫共沉淀（Co-IP）、RIP、Chip等等，將幾種實驗簡單概述一下。

建議按照2×106每孔的數(shù)量將293T細胞均勻鋪入。(2)第二天：在24小時之內，觀察293T細胞的匯合度在90%~95%之間時，向其中加入DNA-脂質體復合體，DNA-脂質體復合體制備方法如下：a)輕輕混勻LipoMax，根據(jù)說明書加入相應量于500μlOpti-MEM無血清培養(yǎng)基中，混合均勻并置于室溫5分鐘。b)在500μlOpti-MEM無血清培養(yǎng)基中稀釋DNA，總質量為15μg按照載體質粒:psPAX2:=4:3:1的比例加入DNA。c)將稀釋后的LipoMax和稀釋后的DNA輕輕混勻，常溫靜置20分鐘，形成DNA-LipoMax復合體。(3)將DNA-LipoMax復合體輕柔地滴加至細胞培養(yǎng)皿中，輕輕搖晃培養(yǎng)皿混勻，放入細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。(4)病毒收集濃縮病毒：加入DNA-LipoMax復合體48小時后，收集病毒上清，同時加入10ml預溫的293T培養(yǎng)基到細胞培養(yǎng)皿中。將收集到的病毒上清存在4℃冰箱中;收集72小時病毒上清，與48小時病毒上清混在一起。將離心機溫度降溫到4℃，600g，離心5分鐘，去除其中的細胞碎片，上清液經μm濾頭過濾，加入病毒濃縮液，配制濃縮病毒液。將濃縮后的病毒放于4℃冰箱搖床上，旋轉過夜。第二天，4度離心機，3000~4000g離心15分鐘。棄掉上清液，加入1Xpbs或培養(yǎng)基重懸。這種技術是將蛋白質視為抗原，并利用抗體與之進行特異性結合的特性，來進行研究。廣西動物科研技術服務實驗

瘤細胞的增殖活性，從而更好地評估腫、瘤的惡性程度和預后.湖北血液科研技術服務分離

用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選（細胞水平的結合和阻斷）、CAR分子的殺傷活性評價。材料與儀器（以慢pMSCV載體為例）包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質粒、GAG質粒、VSV質粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構建1)根據(jù)目的基因mRNA編碼區(qū)設計引物，分別在引物兩端加入酶切位點EcoRI和BglII。2)從細胞中提取目的基因mRNA，然后逆轉錄成cDNA，然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區(qū)擴增出來。PCR擴增出帶有酶切位點的目的基因編碼區(qū)序列，連接至pMD19-T載體后轉化至感受態(tài)DH5α，分別進行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列，電泳割膠回收純化，連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉化到感受態(tài)DH5α，菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后，送至公司測序、鑒定。4)鑒定成功后，將質粒轉化至感受態(tài)DH5α中，并進行無內質粒抽提。GAG質粒和VSV質粒同樣可以轉化至感受態(tài)DH5α中，并進行無內質粒抽提。質粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養(yǎng)基培養(yǎng)6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。湖北血液科研技術服務分離